Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 SPX-201ENST00000256969 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 DNAH1-201ENST00000420323 13104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 TRIM49D1-201ENST00000420869 1651 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 TRIM49D2-202ENST00000623787 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 ZNF169-203ENST00000480716 2716 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 ZNF185-203ENST00000324823 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 FCAR-201ENST00000345937 608 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 MUC1-209ENST00000368396 516 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 IGKV3-15-201ENST00000390252 442 ntAPPRIS P1 BASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 A2ML1-AS2-201ENST00000394240 386 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 AC006455.4-201ENST00000418297 528 ntTSL 4 BASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 ZNF880-203ENST00000424032 558 ntTSL 4 BASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 AC073188.4-201ENST00000450077 528 ntTSL 4 BASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 LINC01007-203ENST00000451953 579 ntTSL 4 BASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 AC113383.1-205ENST00000502253 792 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
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MKRN4PQ13434 RNU7-179P-201ENST00000516608 68 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 AC090707.1-201ENST00000528795 396 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
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MKRN4PQ13434 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 AL109806.1-201ENST00000623967 1248 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 MIR3120-201ENST00000636555 81 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 TFIP11-217ENST00000619735 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 CORIN-208ENST00000508498 3200 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 AP001528.3-201ENST00000624364 3249 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 VLDLR-203ENST00000382100 9163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 UIMC1-211ENST00000510698 1334 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 DLG2-218ENST00000524982 2872 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
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MKRN4PQ13434 HERC3-201ENST00000264345 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 TCF12-206ENST00000543579 1809 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
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MKRN4PQ13434 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
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MKRN4PQ13434 ZNF317-201ENST00000247956 4073 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
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MKRN4PQ13434 AC079015.1-201ENST00000521793 596 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
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MKRN4PQ13434 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 RN7SL113P-201ENST00000619959 299 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 POLH-201ENST00000372226 3322 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
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MKRN4PQ13434 DHX32-202ENST00000368721 2389 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 ZC3H15-201ENST00000337859 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 MMGT1-201ENST00000305963 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 CLUL1-201ENST00000338387 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 PCBP1-AS1-243ENST00000458698 1893 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 FHL5-203ENST00000541107 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 TLR1-202ENST00000502213 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
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