Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 CNNM2-202ENST00000369878 15857 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 AC079910.1-201ENST00000477099 749 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 MLH3-202ENST00000380968 7819 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 AL031767.1-201ENST00000426374 386 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 ADAD1P2-201ENST00000588476 646 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TCOF1Q13428 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
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