Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 LINC01603-201ENST00000517343 1134 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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HOXD13P35453 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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