Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 AL607077.1-201ENST00000401718 499 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRGP23470 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRGP23470 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRGP23470 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRGP23470 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRGP23470 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRGP23470 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRGP23470 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRGP23470 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRGP23470 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRGP23470 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRGP23470 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRGP23470 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRGP23470 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRGP23470 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRGP23470 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRGP23470 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRGP23470 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRGP23470 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRGP23470 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRGP23470 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRGP23470 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRGP23470 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRGP23470 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRGP23470 AL589740.1-201ENST00000457513 756 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRGP23470 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRGP23470 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRGP23470 MEG8-217ENST00000556637 924 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
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