Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 MAGI2-AS3-204ENST00000426835 738 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 NDUFA5P1-201ENST00000433858 341 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 AC011405.1-202ENST00000504658 803 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 NRG1-IT1-201ENST00000520444 758 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 AL162233.1-201ENST00000620014 944 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 Z99916.1-201ENST00000454253 482 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 NPM1P45-201ENST00000583151 559 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 ASAH1-224ENST00000636269 685 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TM6SF1Q9BZW5 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.8 ms