Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AC012409.1-202ENST00000558449 639 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.69
NRF1Q16656 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NRF1Q16656 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NRF1Q16656 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
NRF1Q16656 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
NRF1Q16656 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
NRF1Q16656 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NRF1Q16656 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NRF1Q16656 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NRF1Q16656 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NRF1Q16656 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NRF1Q16656 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
NRF1Q16656 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NRF1Q16656 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NRF1Q16656 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
NRF1Q16656 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NRF1Q16656 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
NRF1Q16656 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NRF1Q16656 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
NRF1Q16656 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NRF1Q16656 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NRF1Q16656 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
NRF1Q16656 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NRF1Q16656 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
NRF1Q16656 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NRF1Q16656 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
NRF1Q16656 AC105020.2-201ENST00000564683 572 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
NRF1Q16656 AC009137.2-201ENST00000568179 641 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
NRF1Q16656 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
NRF1Q16656 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.2 ms