Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 SULT1C2-205ENST00000437390 1359 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SEC23BQ15437 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms