Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AP000919.1-202ENST00000581139 1264 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC011473.1-201ENST00000601280 443 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AL049844.2-201ENST00000604280 628 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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ZNF548Q8NEK5 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
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ZNF548Q8NEK5 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ZNF548Q8NEK5 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
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