Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 ZNF14-201ENST00000344099 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 SAGE3P-201ENST00000619800 1635 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 HBS1L-212ENST00000527578 2618 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 PPFIA2-205ENST00000541570 2976 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 ZNF677-206ENST00000598513 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 IL2RA-203ENST00000379959 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 LRRIQ3-201ENST00000354431 2849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 TMEFF2-203ENST00000409056 3364 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 KBTBD8-202ENST00000460576 984 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 MMP2-AS1-203ENST00000620495 625 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 OFCC1-218ENST00000622909 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 LINC01677-204ENST00000635342 1329 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 PTK2-228ENST00000521059 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AL357568.1-201ENST00000421530 1963 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 HABP2-201ENST00000351270 3009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 PLEKHA1-204ENST00000392799 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 REG1CP-201ENST00000377435 1705 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 CYP19A1-202ENST00000396404 2388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 BMX-201ENST00000342014 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 RPL5P5-201ENST00000392009 893 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
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