Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 GLRXP2-201ENST00000555594 321 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AP000919.1-202ENST00000581139 1264 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
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FOXD4Q12950 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
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FOXD4Q12950 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
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FOXD4Q12950 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
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FOXD4Q12950 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
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FOXD4Q12950 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
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FOXD4Q12950 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
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