Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
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USP35Q9P2H5 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
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