Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AL138767.3-201ENST00000438082 495 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AL139161.1-201ENST00000443207 190 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC092601.1-201ENST00000444526 383 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 ATP5J2-205ENST00000449683 460 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 CPHL1P-204ENST00000482639 584 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC005180.2-201ENST00000585620 562 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 ZNF790-AS1-201ENST00000587278 653 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 ZNF137P-202ENST00000597158 308 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AL049767.1-201ENST00000636811 514 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 SAMD3-205ENST00000457563 1877 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 XAGE3-201ENST00000346279 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
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