Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 NDUFA5P1-201ENST00000433858 341 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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CCDC142Q17RM4 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
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CCDC142Q17RM4 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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CCDC142Q17RM4 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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CCDC142Q17RM4 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
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