Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
USF2Q15853 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
USF2Q15853 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
USF2Q15853 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
USF2Q15853 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
USF2Q15853 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
USF2Q15853 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
USF2Q15853 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
USF2Q15853 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
USF2Q15853 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
USF2Q15853 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
USF2Q15853 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
USF2Q15853 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
USF2Q15853 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
USF2Q15853 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
USF2Q15853 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
USF2Q15853 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
USF2Q15853 LINC01307-202ENST00000444327 771 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
USF2Q15853 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
USF2Q15853 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
USF2Q15853 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
USF2Q15853 AL137001.1-201ENST00000450212 199 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
USF2Q15853 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
USF2Q15853 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
USF2Q15853 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
USF2Q15853 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
USF2Q15853 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
USF2Q15853 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
USF2Q15853 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
USF2Q15853 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
USF2Q15853 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
USF2Q15853 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
USF2Q15853 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
USF2Q15853 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
USF2Q15853 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
USF2Q15853 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
USF2Q15853 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
USF2Q15853 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
USF2Q15853 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
USF2Q15853 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
USF2Q15853 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
USF2Q15853 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
USF2Q15853 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
USF2Q15853 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
USF2Q15853 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
USF2Q15853 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
USF2Q15853 AL049844.2-201ENST00000604280 628 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
USF2Q15853 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
USF2Q15853 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
USF2Q15853 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
USF2Q15853 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
USF2Q15853 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
USF2Q15853 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
USF2Q15853 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
USF2Q15853 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
USF2Q15853 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
USF2Q15853 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
USF2Q15853 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
USF2Q15853 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
USF2Q15853 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
USF2Q15853 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
USF2Q15853 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
USF2Q15853 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
USF2Q15853 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
USF2Q15853 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
USF2Q15853 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
USF2Q15853 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
USF2Q15853 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
USF2Q15853 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
USF2Q15853 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
USF2Q15853 AC087380.1-202ENST00000415970 1163 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
USF2Q15853 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
USF2Q15853 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
USF2Q15853 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
USF2Q15853 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
USF2Q15853 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
USF2Q15853 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
USF2Q15853 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
USF2Q15853 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
USF2Q15853 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
USF2Q15853 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
USF2Q15853 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
USF2Q15853 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
USF2Q15853 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
USF2Q15853 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
USF2Q15853 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
USF2Q15853 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
USF2Q15853 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
USF2Q15853 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
USF2Q15853 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
USF2Q15853 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
USF2Q15853 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
USF2Q15853 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
USF2Q15853 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
USF2Q15853 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
USF2Q15853 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
USF2Q15853 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
USF2Q15853 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
USF2Q15853 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
USF2Q15853 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
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