Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.6 ms