Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
RPS29P62273 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
RPS29P62273 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RPS29P62273 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
RPS29P62273 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
RPS29P62273 RRN3-202ENST00000327307 2039 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
RPS29P62273 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
RPS29P62273 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
RPS29P62273 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
RPS29P62273 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RPS29P62273 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RPS29P62273 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
RPS29P62273 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RPS29P62273 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RPS29P62273 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
RPS29P62273 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
RPS29P62273 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RPS29P62273 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RPS29P62273 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RPS29P62273 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RPS29P62273 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
RPS29P62273 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
RPS29P62273 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
RPS29P62273 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
RPS29P62273 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
RPS29P62273 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
RPS29P62273 NECTIN3-AS1-202ENST00000467426 664 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
RPS29P62273 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
RPS29P62273 AK5-208ENST00000478255 556 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
RPS29P62273 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RPS29P62273 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
RPS29P62273 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RPS29P62273 AC010245.1-201ENST00000511329 754 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
RPS29P62273 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
RPS29P62273 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
RPS29P62273 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
RPS29P62273 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
RPS29P62273 AC104984.1-201ENST00000581633 697 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
RPS29P62273 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
RPS29P62273 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RPS29P62273 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RPS29P62273 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RPS29P62273 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RPS29P62273 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
RPS29P62273 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
RPS29P62273 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
RPS29P62273 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
RPS29P62273 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
RPS29P62273 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RPS29P62273 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
RPS29P62273 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
RPS29P62273 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
RPS29P62273 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
RPS29P62273 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
RPS29P62273 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
RPS29P62273 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RPS29P62273 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
RPS29P62273 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
RPS29P62273 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
RPS29P62273 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
RPS29P62273 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
RPS29P62273 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
RPS29P62273 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
RPS29P62273 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
RPS29P62273 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
RPS29P62273 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
RPS29P62273 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
RPS29P62273 GPR174-201ENST00000276077 1258 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
RPS29P62273 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RPS29P62273 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RPS29P62273 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RPS29P62273 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RPS29P62273 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RPS29P62273 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RPS29P62273 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
RPS29P62273 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RPS29P62273 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RPS29P62273 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
RPS29P62273 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
RPS29P62273 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RPS29P62273 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RPS29P62273 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RPS29P62273 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
RPS29P62273 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
RPS29P62273 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RPS29P62273 AP002981.1-201ENST00000517692 975 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RPS29P62273 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
RPS29P62273 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RPS29P62273 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
RPS29P62273 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
RPS29P62273 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
RPS29P62273 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
RPS29P62273 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
RPS29P62273 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
RPS29P62273 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RPS29P62273 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RPS29P62273 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
RPS29P62273 AP001160.4-201ENST00000596971 382 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RPS29P62273 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RPS29P62273 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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