Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CENPFP49454 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CENPFP49454 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CENPFP49454 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CENPFP49454 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CENPFP49454 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CENPFP49454 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CENPFP49454 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CENPFP49454 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CENPFP49454 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CENPFP49454 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CENPFP49454 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CENPFP49454 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CENPFP49454 ITSN2-202ENST00000361999 5814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CENPFP49454 ZFX-202ENST00000338565 2906 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CENPFP49454 RSF1-201ENST00000308488 11550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CENPFP49454 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CENPFP49454 TCEANC2-201ENST00000234827 10436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CENPFP49454 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CENPFP49454 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CENPFP49454 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CENPFP49454 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CENPFP49454 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CENPFP49454 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CENPFP49454 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CENPFP49454 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CENPFP49454 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CENPFP49454 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CENPFP49454 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CENPFP49454 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CENPFP49454 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CENPFP49454 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CENPFP49454 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CENPFP49454 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CENPFP49454 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CENPFP49454 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CENPFP49454 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CENPFP49454 AC021180.1-201ENST00000508581 558 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CENPFP49454 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CENPFP49454 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CENPFP49454 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CENPFP49454 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CENPFP49454 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CENPFP49454 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CENPFP49454 AC120036.2-201ENST00000509729 1474 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CENPFP49454 ZNF793-201ENST00000445217 6712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CENPFP49454 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CENPFP49454 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CENPFP49454 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
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CENPFP49454 LINC02422-201ENST00000535163 852 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
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CENPFP49454 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
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CENPFP49454 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
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CENPFP49454 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CENPFP49454 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CENPFP49454 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CENPFP49454 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
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CENPFP49454 RPL14-201ENST00000338970 7072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
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CENPFP49454 ABL2-201ENST00000344730 6910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CENPFP49454 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
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CENPFP49454 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CENPFP49454 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CENPFP49454 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CENPFP49454 AC239809.3-202ENST00000628902 686 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CENPFP49454 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CENPFP49454 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CENPFP49454 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CENPFP49454 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CENPFP49454 FSTL5-202ENST00000379164 4757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CENPFP49454 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CENPFP49454 KIDINS220-206ENST00000473731 7248 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CENPFP49454 SLC7A6-209ENST00000566454 6308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CENPFP49454 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CENPFP49454 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CENPFP49454 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CENPFP49454 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CENPFP49454 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CENPFP49454 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CENPFP49454 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CENPFP49454 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CENPFP49454 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CENPFP49454 TSC1-201ENST00000298552 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CENPFP49454 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CENPFP49454 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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