Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 OR5B21-201ENST00000360374 931 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 S100A1-203ENST00000368698 784 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AIF1L-202ENST00000372297 418 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 IGLV11-55-201ENST00000390286 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 TRBV7-4-201ENST00000390369 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RPL24P7-201ENST00000399435 453 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AL590286.1-201ENST00000404178 291 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 GSTA10P-201ENST00000412182 576 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 MAGEA13P-201ENST00000418272 951 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 LINC02068-202ENST00000424941 563 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 ETDA-201ENST00000427686 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC097468.2-201ENST00000429343 553 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 GAPDHP19-201ENST00000431768 1005 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 CYP2C58P-201ENST00000436281 475 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AL606534.2-201ENST00000436756 624 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 PCNPP2-201ENST00000441651 455 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC073336.1-201ENST00000448767 664 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 OR7H1P-201ENST00000448965 922 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 MYB-AS1-201ENST00000455534 449 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC016735.1-201ENST00000457457 237 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RN7SL153P-201ENST00000486501 292 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AP002026.1-203ENST00000506160 524 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC095057.1-201ENST00000507583 168 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 ADI1P2-201ENST00000514945 429 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 IMPA1P1-202ENST00000522318 332 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 ASPH-225ENST00000522835 1258 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AP000757.1-202ENST00000525260 891 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RASA4-217ENST00000538869 483 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 PCED1B-AS1-205ENST00000548222 625 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AL358332.1-201ENST00000555649 813 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 LINC01146-203ENST00000555996 459 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 PWRN1-210ENST00000568045 1299 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC126773.1-201ENST00000569654 547 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RPL17-212ENST00000581373 584 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC026254.3-201ENST00000584490 322 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 VDAC1P5-201ENST00000603132 844 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC019257.2-201ENST00000605539 497 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 OR1X1P-201ENST00000606159 931 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC104117.5-201ENST00000606195 547 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 HIST1H2BJ-203ENST00000607124 950 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 LINC00837-203ENST00000608061 555 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AP005329.3-201ENST00000609924 686 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC239809.3-218ENST00000616018 1023 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC010087.1-201ENST00000618630 438 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RMDN2-AS1-207ENST00000627614 765 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AL590396.3-201ENST00000636334 300 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AL353795.1-201ENST00000439134 1775 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AQP4-205ENST00000581374 1586 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 TNFRSF19-203ENST00000382263 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 ADA2-210ENST00000610390 4137 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RDH11-203ENST00000553384 1926 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.7 ms