Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 GAPDHP37-201ENST00000442317 968 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC003035.2-201ENST00000448948 696 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC078788.2-201ENST00000462300 382 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 RPS12P20-201ENST00000464109 380 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 RPL5P23-201ENST00000496040 868 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC008708.1-201ENST00000517346 474 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC105020.2-201ENST00000564683 572 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC087292.1-201ENST00000573371 512 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 MIR4685-201ENST00000578185 69 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 ADAD1P2-201ENST00000588476 646 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 TMEM55A-206ENST00000630164 171 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 HYAL4-202ENST00000476325 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 SAMD13-204ENST00000370671 724 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 RPS10P14-201ENST00000440748 502 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 LINC02384-202ENST00000441255 567 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 XXYLT1-AS2-202ENST00000447975 784 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC239804.1-201ENST00000466343 869 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 RPL5P15-201ENST00000475870 897 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 LINC02483-201ENST00000512043 1143 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 SNORA70.17-201ENST00000516449 133 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 ATP6V0E1-202ENST00000517669 502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AP000842.2-202ENST00000526211 569 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AL358292.1-201ENST00000554181 412 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
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