Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AC011468.1-201ENST00000569091 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 SLC35F5-213ENST00000638402 1554 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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PTPRCP08575 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 TIFA-202ENST00000500655 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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PTPRCP08575 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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PTPRCP08575 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 AC005229.3-201ENST00000603438 323 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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PTPRCP08575 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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PTPRCP08575 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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PTPRCP08575 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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PTPRCP08575 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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PTPRCP08575 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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PTPRCP08575 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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PTPRCP08575 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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PTPRCP08575 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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PTPRCP08575 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRCP08575 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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