Protein–RNA interactions for Protein: D6R9N7

USP17L18, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L18D6R9N7 OR2T2-202ENST00000641925 3530 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 MAPK10-323ENST00000641493 3207 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 DNAH17-202ENST00000585328 13708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 AC016229.2-201ENST00000591331 417 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 ZNF675-208ENST00000601010 669 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 AC130448.2-201ENST00000624082 374 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 SETDB1-205ENST00000368969 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 COG2-209ENST00000534989 2963 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 ZNF227-213ENST00000621083 3055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 C1orf132-203ENST00000608023 15145 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 FAT2-201ENST00000261800 14534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 CHST12-201ENST00000258711 15979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 SLC14A1-208ENST00000586142 2846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 AC007406.5-201ENST00000570140 3170 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 ETFBKMT-201ENST00000357721 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 NRK-201ENST00000243300 8062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 AC012618.3-201ENST00000415793 2042 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 TMEM132B-206ENST00000613307 9659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 PARN-201ENST00000341484 2100 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 RNU1-24P-201ENST00000364285 165 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 COX6B1P4-201ENST00000519826 484 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
USP17L18D6R9N7 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms