Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 FKTN-202ENST00000357998 2404 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 SLC14A1-201ENST00000321925 3971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 BDNF-212ENST00000525528 4766 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 WDR93-204ENST00000558000 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 UG0898H09-202ENST00000623646 7040 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 SCG5-201ENST00000300175 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 NCR2-201ENST00000373083 1154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 RPL24P7-201ENST00000399435 453 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 AC009743.1-201ENST00000415774 610 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 RPSAP1-201ENST00000421328 880 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 EEF1A1P27-201ENST00000429983 1135 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 AL451074.4-201ENST00000447545 470 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 VN1R6P-201ENST00000458417 907 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 RPL12P40-201ENST00000467028 488 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 MRPS33-203ENST00000467334 622 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 AC011352.2-201ENST00000514574 1016 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 LRTOMT-215ENST00000538478 814 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 AC078860.1-201ENST00000546601 527 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 GOLGA6L5P-203ENST00000559768 578 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 MIR663AHG-213ENST00000596767 837 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 AC211486.5-201ENST00000616609 775 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 AC243830.2-201ENST00000618067 630 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 pRNA.9-201ENST00000618609 89 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL680P-201ENST00000620379 299 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 SLC12A1-202ENST00000380993 4707 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 PIGN-207ENST00000586566 3891 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 CDY1-202ENST00000361963 2177 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 NUDT13-206ENST00000537969 2151 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF793-202ENST00000542455 4073 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 KIF20A-201ENST00000394894 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 TNFRSF19-203ENST00000382263 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 MRO-201ENST00000256425 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 AGXT2-201ENST00000231420 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 AKR1C2-201ENST00000380753 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 UGT2B27P-201ENST00000505092 1620 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF571-205ENST00000590751 1700 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 PPFIA2-205ENST00000541570 2976 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 POLQ-204ENST00000621776 9055 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 TEX14-203ENST00000389934 4927 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 KCNIP4-201ENST00000359001 2168 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF790-206ENST00000613249 2183 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 ARL17A-202ENST00000336125 3945 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 AL133320.1-201ENST00000621423 2352 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 TBX15-201ENST00000207157 3492 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 PMFBP1-201ENST00000237353 3527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 AL139384.2-201ENST00000613809 3590 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP260-201ENST00000363849 111 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 RGS8-202ENST00000367556 843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 PFKFB1-201ENST00000374992 1156 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 FAM107B-203ENST00000378462 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TIMMDC1Q9NPL8 MIR199B-201ENST00000384849 110 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
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