Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AL356476.1-201ENST00000421481 480 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 LINC02083-201ENST00000462835 515 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC092349.1-201ENST00000504903 310 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC009167.1-201ENST00000568317 579 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC136443.4-201ENST00000568759 579 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AL645927.2-201ENST00000618350 349 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC104078.2-201ENST00000504344 541 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
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