Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
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SP140Q13342 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SP140Q13342 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SP140Q13342 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SP140Q13342 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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SP140Q13342 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SP140Q13342 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SP140Q13342 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SP140Q13342 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SP140Q13342 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SP140Q13342 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SP140Q13342 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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SP140Q13342 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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SP140Q13342 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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SP140Q13342 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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SP140Q13342 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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SP140Q13342 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SP140Q13342 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
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SP140Q13342 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
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SP140Q13342 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
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SP140Q13342 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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SP140Q13342 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SP140Q13342 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SP140Q13342 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SP140Q13342 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SP140Q13342 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SP140Q13342 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SP140Q13342 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SP140Q13342 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
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