Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 GLRXP2-201ENST00000555594 321 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 TPT1P3-201ENST00000492841 512 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PTP4A2Q12974 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.4 ms