Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 SNHG27-203ENST00000514222 680 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 LINC01362-202ENST00000452901 1712 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 OR3A3-203ENST00000641141 3800 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 TMEM30CP-203ENST00000637814 1035 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 AC060834.2-201ENST00000447999 618 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 LINC00632-204ENST00000602830 597 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 AP005901.4-201ENST00000577336 569 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRGP23470 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187.8 ms