Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC013652.1-202ENST00000561058 570 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC007333.2-201ENST00000569998 559 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 OR8H1-202ENST00000610894 927 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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