Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms