Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 TRIM37-212ENST00000584889 353 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 CENPJ-206ENST00000616936 5020 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 MEF2C-AS1-214ENST00000514794 2350 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 AP001157.1-201ENST00000550837 2339 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 AC241584.2-201ENST00000637142 2090 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 USP9X-201ENST00000324545 12401 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 GYPA-214ENST00000641688 1764 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 AC061975.7-201ENST00000592016 2692 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 MLH3-201ENST00000355774 7896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 PEAK1-202ENST00000558305 4644 ntTSL 4 BASIC7.38□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 LINC02092-201ENST00000455366 2472 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 CHST12-201ENST00000258711 15979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 TPD52-203ENST00000448733 4339 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 TIMM21-201ENST00000169551 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 TEAD1-201ENST00000334310 3075 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 MDM4-204ENST00000367183 9098 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 AC044784.1-201ENST00000456526 677 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC7.38□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 AC073581.1-201ENST00000519036 575 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC7.38□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 AL450226.2-201ENST00000622913 439 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 ARMCX5-202ENST00000372742 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 GJB6-205ENST00000636852 1840 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.38□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 AL589993.1-201ENST00000407450 2524 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 PUS10-201ENST00000316752 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 SLC4A10-204ENST00000421911 3398 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 FBXL17-203ENST00000496714 3773 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 GJC1-207ENST00000590758 7566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 ZNF559-ZNF177-202ENST00000446085 2470 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 AP001636.3-201ENST00000533954 2810 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.2 ms