Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 SEPHS1P4-201ENST00000446112 1176 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 CLCA3P-203ENST00000490028 2781 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 MCCC1-210ENST00000492597 2774 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 CSNK1A1-210ENST00000606719 835 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AC044839.1-206ENST00000635559 1324 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 LRRC37A3-203ENST00000339474 2589 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 BCL2L14-201ENST00000266434 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AC110597.1-201ENST00000562669 3176 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 DAZ3-202ENST00000382365 3503 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 OFD1P10Y-201ENST00000434110 1433 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AC013549.1-201ENST00000454086 566 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.2 ms