Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 OR1F12-201ENST00000402365 945 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 MAPRE1P3-201ENST00000435438 796 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 AL049874.4-201ENST00000557593 255 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HHLA1C9JL84 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms