Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 AC120036.2-201ENST00000509729 1474 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 AC087380.1-202ENST00000415970 1163 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 AC106806.2-201ENST00000509365 500 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 AC010476.1-201ENST00000519111 851 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 RERGL-203ENST00000538724 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 LINC02335-201ENST00000616578 659 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ERVV-1B6SEH8 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.1 ms