Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 PSMA2P2-201ENST00000504319 686 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC090888.3-201ENST00000558917 509 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms