Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
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SP140Q13342 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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SP140Q13342 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SP140Q13342 TTN-AS1-226ENST00000588716 604 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
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SP140Q13342 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SP140Q13342 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SP140Q13342 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SP140Q13342 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SP140Q13342 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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SP140Q13342 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SP140Q13342 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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SP140Q13342 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SP140Q13342 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
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SP140Q13342 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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SP140Q13342 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SP140Q13342 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SP140Q13342 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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SP140Q13342 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SP140Q13342 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SP140Q13342 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SP140Q13342 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SP140Q13342 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SP140Q13342 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SP140Q13342 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SP140Q13342 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
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