Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TMPOP42166 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TMPOP42166 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TMPOP42166 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TMPOP42166 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TMPOP42166 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TMPOP42166 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TMPOP42166 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TMPOP42166 MTUS2-AS2-202ENST00000434779 720 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TMPOP42166 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TMPOP42166 LINC01781-202ENST00000443104 591 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TMPOP42166 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TMPOP42166 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TMPOP42166 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TMPOP42166 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TMPOP42166 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TMPOP42166 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TMPOP42166 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TMPOP42166 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TMPOP42166 LINC02422-201ENST00000535163 852 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TMPOP42166 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TMPOP42166 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TMPOP42166 AC020763.5-201ENST00000623298 430 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TMPOP42166 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TMPOP42166 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TMPOP42166 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TMPOP42166 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TMPOP42166 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TMPOP42166 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TMPOP42166 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TMPOP42166 SMCO1-201ENST00000397537 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TMPOP42166 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TMPOP42166 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TMPOP42166 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TMPOP42166 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TMPOP42166 UBE2V2P1-201ENST00000434717 398 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TMPOP42166 FCF1P7-201ENST00000451185 558 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TMPOP42166 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TMPOP42166 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TMPOP42166 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TMPOP42166 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TMPOP42166 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TMPOP42166 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TMPOP42166 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TMPOP42166 AC103853.1-201ENST00000520588 649 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TMPOP42166 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TMPOP42166 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TMPOP42166 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TMPOP42166 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TMPOP42166 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TMPOP42166 AC007333.2-201ENST00000569998 559 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TMPOP42166 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TMPOP42166 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TMPOP42166 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TMPOP42166 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TMPOP42166 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TMPOP42166 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TMPOP42166 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TMPOP42166 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TMPOP42166 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TMPOP42166 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TMPOP42166 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TMPOP42166 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TMPOP42166 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TMPOP42166 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TMPOP42166 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TMPOP42166 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TMPOP42166 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TMPOP42166 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TMPOP42166 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TMPOP42166 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TMPOP42166 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TMPOP42166 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TMPOP42166 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TMPOP42166 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TMPOP42166 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TMPOP42166 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TMPOP42166 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TMPOP42166 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TMPOP42166 C2orf80-207ENST00000453017 722 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TMPOP42166 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TMPOP42166 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TMPOP42166 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TMPOP42166 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TMPOP42166 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TMPOP42166 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TMPOP42166 RN7SL205P-201ENST00000490174 284 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TMPOP42166 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TMPOP42166 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TMPOP42166 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TMPOP42166 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TMPOP42166 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TMPOP42166 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TMPOP42166 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TMPOP42166 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TMPOP42166 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TMPOP42166 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TMPOP42166 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TMPOP42166 AC015849.6-201ENST00000605454 474 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TMPOP42166 AC239803.2-201ENST00000610161 430 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.8 ms