Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 RMST-210ENST00000640149 2844 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 MEF2C-244ENST00000636998 5936 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 CNTNAP4-209ENST00000622250 3783 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 ZBED3-AS1-216ENST00000515356 1987 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 NRXN3-203ENST00000428277 4219 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC115223.1-201ENST00000466377 870 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC007998.4-201ENST00000612496 2533 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 SYTL5-201ENST00000297875 4722 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 CHRM3-AS2-201ENST00000427859 2431 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC092828.1-201ENST00000501211 5391 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 ETFBKMT-201ENST00000357721 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 ARHGAP32-201ENST00000310343 10111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 ZNF106-201ENST00000263805 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 PHLPP2-201ENST00000393524 8467 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 HMG20A-202ENST00000381714 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 FAM160A1-203ENST00000505231 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 NKRF-204ENST00000542113 3351 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.8 ms