Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 AC135178.3-202ENST00000580537 579 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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CCDC93Q567U6 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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CCDC93Q567U6 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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CCDC93Q567U6 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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CCDC93Q567U6 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC93Q567U6 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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