Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC011468.1-201ENST00000569091 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.7 ms