Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 BPIFC-204ENST00000534972 1809 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 MDGA2-201ENST00000357362 2965 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC6.79□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 NUP107-211ENST00000539906 3004 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 SNHG27-203ENST00000514222 680 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.1 ms