Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AC092807.3-203ENST00000467530 2745 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AL133243.4-201ENST00000623116 3109 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 KLHL7-203ENST00000409689 3231 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 PPP2R5C-205ENST00000445439 1526 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 NSUN6-201ENST00000377304 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC060834.2-201ENST00000447999 618 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC021220.1-201ENST00000507445 630 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC063926.1-201ENST00000539532 415 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC087721.1-201ENST00000559959 476 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 ABCB5-203ENST00000406935 1483 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 ADAM2-201ENST00000265708 2672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC010168.2-201ENST00000562691 5428 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 LCOR-201ENST00000286067 4542 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 MORC3-201ENST00000400485 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 CHURC1-208ENST00000607599 3615 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 NDUFA4-201ENST00000339600 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 FBXW7-203ENST00000296555 3572 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 GART-204ENST00000381831 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 HYDIN-215ENST00000541601 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 TMC5-206ENST00000561503 2487 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 SMG1-210ENST00000565224 2372 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 HSD17B13-201ENST00000302219 2269 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 TMEM167B-201ENST00000338272 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 CLEC3A-201ENST00000299642 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AMY1A-201ENST00000370083 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 KRTAP3-4P-201ENST00000430780 280 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 ENTPD3-AS1-204ENST00000452768 724 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC096922.1-201ENST00000461635 651 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 PFN2-217ENST00000498307 556 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AC005832.1-201ENST00000544380 572 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCDC85BQ15834 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms