Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
RUNX3Q13761 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 CASKP1-201ENST00000412870 582 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 ASNSP4-201ENST00000511103 447 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 LINC00535-203ENST00000520096 790 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 LINC02422-201ENST00000535163 852 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 AC022417.1-201ENST00000624768 1303 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 MTCO1P8-201ENST00000416914 1523 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 OR5AQ1P-203ENST00000641818 1529 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 EIF2S2P2-201ENST00000447161 982 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 BX119904.3-201ENST00000428194 957 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms