Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
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TCIRG1Q13488 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
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TCIRG1Q13488 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
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TCIRG1Q13488 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
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TCIRG1Q13488 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
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TCIRG1Q13488 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
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TCIRG1Q13488 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
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TCIRG1Q13488 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
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TCIRG1Q13488 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
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TCIRG1Q13488 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
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TCIRG1Q13488 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TCIRG1Q13488 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
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