Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
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TOP3AQ13472 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 XAGE3-201ENST00000346279 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
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TOP3AQ13472 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
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TOP3AQ13472 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
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TOP3AQ13472 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
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TOP3AQ13472 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 LRRC23-208ENST00000436789 796 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
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TOP3AQ13472 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AL356157.1-201ENST00000456722 732 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
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TOP3AQ13472 MINOS1P4-201ENST00000515470 318 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 ATP6V0E1-202ENST00000517669 502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
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TOP3AQ13472 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
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TOP3AQ13472 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
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TOP3AQ13472 LINC01855-201ENST00000585520 396 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
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TOP3AQ13472 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
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TOP3AQ13472 AL390877.1-201ENST00000605704 214 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
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TOP3AQ13472 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
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TOP3AQ13472 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
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TOP3AQ13472 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
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TOP3AQ13472 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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TOP3AQ13472 GABRA2-215ENST00000540012 2588 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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TOP3AQ13472 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 RN7SKP257-201ENST00000364525 309 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC026310.1-201ENST00000396004 378 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
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TOP3AQ13472 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AL139184.1-202ENST00000422303 222 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AL450003.1-201ENST00000439447 455 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 MIR205HG-206ENST00000440276 539 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AL451164.3-201ENST00000441377 447 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 RPSAP40-201ENST00000442343 891 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TOP3AQ13472 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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