Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC35F5-213ENST00000638402 1554 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL47-201ENST00000259038 1126 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEC61G-201ENST00000352861 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR138-2-201ENST00000384916 84 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CASP5-203ENST00000418434 1023 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BBIP1-205ENST00000436562 383 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TREML3P-201ENST00000457327 501 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC024267.3-201ENST00000579673 562 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RMDN2-AS1-203ENST00000601029 613 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WBP1LP12-201ENST00000604449 331 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AHSA2-203ENST00000410073 479 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC024601.1-201ENST00000427247 524 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00328-2P-201ENST00000436585 219 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms