Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z309

Cib2, Calcium and integrin-binding family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib2Q9Z309 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cib2Q9Z309 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cib2Q9Z309 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms