Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nrf1Q9WU00 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrf1Q9WU00 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms