Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Psma4Q9R1P0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psma4Q9R1P0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Psma4Q9R1P0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psma4Q9R1P0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psma4Q9R1P0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psma4Q9R1P0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psma4Q9R1P0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psma4Q9R1P0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psma4Q9R1P0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psma4Q9R1P0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psma4Q9R1P0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psma4Q9R1P0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psma4Q9R1P0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psma4Q9R1P0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psma4Q9R1P0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psma4Q9R1P0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psma4Q9R1P0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psma4Q9R1P0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psma4Q9R1P0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psma4Q9R1P0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psma4Q9R1P0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psma4Q9R1P0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psma4Q9R1P0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psma4Q9R1P0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psma4Q9R1P0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psma4Q9R1P0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psma4Q9R1P0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psma4Q9R1P0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psma4Q9R1P0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psma4Q9R1P0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psma4Q9R1P0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psma4Q9R1P0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psma4Q9R1P0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psma4Q9R1P0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psma4Q9R1P0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psma4Q9R1P0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psma4Q9R1P0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psma4Q9R1P0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psma4Q9R1P0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psma4Q9R1P0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psma4Q9R1P0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psma4Q9R1P0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psma4Q9R1P0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psma4Q9R1P0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psma4Q9R1P0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Psma4Q9R1P0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psma4Q9R1P0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms