Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1I1

Chst4, Carbohydrate sulfotransferase 4, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst4Q9R1I1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Chst4Q9R1I1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Chst4Q9R1I1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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