Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cln8Q9QUK3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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