Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms